• Intro

  • slide_01
  • slide_02
  • slide_03
  • slide_04
  • slide_05
  • slide_06
  • slide_07
  • slide_08
  • slide_09
  • slide_10
  • slide_11
  • slide_12
  • slide_13
  • slide_14
  • slide_15
  • slide_16
  • slide_17
  • slide_18
  • slide_19
  • slide_20
  • slide_21
  • slide_22
  • slide_23
  • slide_24

  • Credits



  • CGPDB
    UC Davis


    Software Listing:


  • Web server Apache

  • mySQL database

  • PHP and phpMyAdmin

  • Phred-Phrap-CrossMatch

  • CAP3 assembler

  • NCBI BLAST

  • tcl_blast_parser_123.tcl (developed at UCD)

  • Graph9 program (developed at UCD)

  • PhyloGrapher (developed at UCD)

  • GenomePixelizer (developed at UCD)